今から1,300年ほど前に、日証上人が琴弾八幡宮の別当として創立。国の重要文化財観音寺金堂があります。大同年間弘法大師が7代住職の時、本尊　聖観世音菩薩をはじめ諸像を安置し、七堂伽藍を建立して観音寺と改めました。四国霊場88ケ所の内、琴弾八幡宮が68場番札所、観音寺が69番札所でしたが、明治初年の神仏分離で、西金堂に移して神恵院の本堂とし、68番札所としたため、四国霊場で唯一の珍しい1山2霊場となりました。